Pismo w sprawie odliczenia VAT w JPK

nasz klienta rozliczany wg kpir +VAT od 2017r. ma wysyłane pliki JPK; w toku wybiórczego sprawdzania XXXX 2017r. Urząd Skarbowy stwierdził odliczenie VAT-u z faktury od klienta nie widniejącego w rejestrze VAT-owców. Skontaktowaliśmy się z kontrahentem, wg niego winno być w porządku bo od roku jak prowadzi firmę składa dekl. VAT7 i płaci podatek; oczywiści na nasze zalecenie zgłosił się do swojego urzędu celem wyjaśnienia - procedura trwa już 2 miesiące i póki co niewiele wiemy, a kolejno kontrolujący klienta urząd wysłał pismo - w załączniku. Proszę o informację jak powinniśmy treść tego pisma traktować, czy jako obowiązek korekty tego lipca i ewentualnie kolejnych miesięcy w który dokonane było odliczenie od tego kontrahenta czy może wyłącznie informacyjnie jako pouczenie jak postępować na przyszłość?